Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pfdn6Q03958 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn6Q03958 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms