Protein–RNA interactions for Protein: P59598

Asxl1, Putative Polycomb group protein ASXL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asxl1P59598 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Asxl1P59598 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Asxl1P59598 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Asxl1P59598 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Asxl1P59598 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Asxl1P59598 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Asxl1P59598 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Asxl1P59598 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Asxl1P59598 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Asxl1P59598 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Asxl1P59598 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Asxl1P59598 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Asxl1P59598 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Asxl1P59598 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Asxl1P59598 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Asxl1P59598 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Asxl1P59598 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Asxl1P59598 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Asxl1P59598 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Asxl1P59598 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Asxl1P59598 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Asxl1P59598 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Asxl1P59598 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Asxl1P59598 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Asxl1P59598 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Asxl1P59598 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Asxl1P59598 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Asxl1P59598 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Asxl1P59598 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Asxl1P59598 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Asxl1P59598 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Asxl1P59598 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Asxl1P59598 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Asxl1P59598 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Asxl1P59598 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms