Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmod1P49813 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod1P49813 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod1P49813 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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