Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb41P48193 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Epb41P48193 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms