Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Capza1P47753 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capza1P47753 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capza1P47753 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capza1P47753 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capza1P47753 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capza1P47753 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms