Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rom1P32958 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rom1P32958 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms