Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AppP12023 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AppP12023 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AppP12023 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AppP12023 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AppP12023 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AppP12023 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AppP12023 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AppP12023 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AppP12023 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
AppP12023 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AppP12023 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AppP12023 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AppP12023 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AppP12023 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AppP12023 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AppP12023 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AppP12023 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AppP12023 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AppP12023 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AppP12023 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AppP12023 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AppP12023 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AppP12023 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AppP12023 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AppP12023 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AppP12023 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AppP12023 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AppP12023 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AppP12023 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AppP12023 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AppP12023 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AppP12023 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AppP12023 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AppP12023 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AppP12023 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AppP12023 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AppP12023 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AppP12023 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AppP12023 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AppP12023 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AppP12023 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AppP12023 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AppP12023 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AppP12023 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms