Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01678 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01678 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01678 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01678 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01678 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01678 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01678 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01678 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01678 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01678 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01678 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01678 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01678 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01678 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01678 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01678 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01678 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms