Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabep1O35551 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabep1O35551 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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