Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r194J3JS27 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r194J3JS27 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms