Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4aF8VPX6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4aF8VPX6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms