Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm8247F6VRJ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm8247F6VRJ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm8247F6VRJ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm8247F6VRJ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm8247F6VRJ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms