Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610001J05RikF2Z3Y9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610001J05RikF2Z3Y9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms