Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm4491E0CX42 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms