Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hacd4A2AKM2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd4A2AKM2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms