Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm5114W4VSN8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm5114W4VSN8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm5114W4VSN8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gm5114W4VSN8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Gm5114W4VSN8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gm5114W4VSN8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gm5114W4VSN8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gm5114W4VSN8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gm5114W4VSN8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gm5114W4VSN8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gm5114W4VSN8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm5114W4VSN8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm5114W4VSN8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm5114W4VSN8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Gm5114W4VSN8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm5114W4VSN8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm5114W4VSN8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm5114W4VSN8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm5114W4VSN8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm5114W4VSN8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm5114W4VSN8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm5114W4VSN8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm5114W4VSN8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm5114W4VSN8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm5114W4VSN8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm5114W4VSN8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm5114W4VSN8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm5114W4VSN8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm5114W4VSN8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gm5114W4VSN8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm5114W4VSN8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm5114W4VSN8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm5114W4VSN8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm5114W4VSN8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm5114W4VSN8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm5114W4VSN8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm5114W4VSN8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm5114W4VSN8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm5114W4VSN8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm5114W4VSN8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms