Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc8a3S4R2P9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8a3S4R2P9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc8a3S4R2P9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc8a3S4R2P9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc8a3S4R2P9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc8a3S4R2P9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc8a3S4R2P9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc8a3S4R2P9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc8a3S4R2P9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc8a3S4R2P9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc8a3S4R2P9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc8a3S4R2P9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc8a3S4R2P9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc8a3S4R2P9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc8a3S4R2P9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc8a3S4R2P9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc8a3S4R2P9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8a3S4R2P9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc8a3S4R2P9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc8a3S4R2P9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc8a3S4R2P9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc8a3S4R2P9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc8a3S4R2P9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc8a3S4R2P9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms