Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2F6

Bcl3, B-cell lymphoma 3 protein homolog, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl3Q9Z2F6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl3Q9Z2F6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bcl3Q9Z2F6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bcl3Q9Z2F6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bcl3Q9Z2F6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bcl3Q9Z2F6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bcl3Q9Z2F6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bcl3Q9Z2F6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bcl3Q9Z2F6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bcl3Q9Z2F6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bcl3Q9Z2F6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms