Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms