Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2aQ9Z255 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2aQ9Z255 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2aQ9Z255 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2aQ9Z255 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2aQ9Z255 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2aQ9Z255 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2aQ9Z255 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2aQ9Z255 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2aQ9Z255 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2aQ9Z255 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2aQ9Z255 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2aQ9Z255 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2aQ9Z255 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2aQ9Z255 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2aQ9Z255 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.8 ms