Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trip6Q9Z1Y4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Trip6Q9Z1Y4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trip6Q9Z1Y4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trip6Q9Z1Y4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trip6Q9Z1Y4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trip6Q9Z1Y4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trip6Q9Z1Y4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trip6Q9Z1Y4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Trip6Q9Z1Y4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trip6Q9Z1Y4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trip6Q9Z1Y4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trip6Q9Z1Y4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trip6Q9Z1Y4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trip6Q9Z1Y4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trip6Q9Z1Y4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Trip6Q9Z1Y4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trip6Q9Z1Y4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Trip6Q9Z1Y4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trip6Q9Z1Y4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Trip6Q9Z1Y4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trip6Q9Z1Y4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trip6Q9Z1Y4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trip6Q9Z1Y4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trip6Q9Z1Y4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trip6Q9Z1Y4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trip6Q9Z1Y4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trip6Q9Z1Y4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trip6Q9Z1Y4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Trip6Q9Z1Y4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trip6Q9Z1Y4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trip6Q9Z1Y4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trip6Q9Z1Y4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Trip6Q9Z1Y4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Trip6Q9Z1Y4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trip6Q9Z1Y4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trip6Q9Z1Y4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Trip6Q9Z1Y4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trip6Q9Z1Y4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trip6Q9Z1Y4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Trip6Q9Z1Y4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Trip6Q9Z1Y4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Trip6Q9Z1Y4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Trip6Q9Z1Y4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Trip6Q9Z1Y4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Trip6Q9Z1Y4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trip6Q9Z1Y4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Trip6Q9Z1Y4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trip6Q9Z1Y4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trip6Q9Z1Y4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Trip6Q9Z1Y4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Trip6Q9Z1Y4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trip6Q9Z1Y4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trip6Q9Z1Y4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trip6Q9Z1Y4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trip6Q9Z1Y4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trip6Q9Z1Y4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Trip6Q9Z1Y4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Trip6Q9Z1Y4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trip6Q9Z1Y4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms