Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdf15Q9Z0J7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdf15Q9Z0J7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdf15Q9Z0J7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gdf15Q9Z0J7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdf15Q9Z0J7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdf15Q9Z0J7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf15Q9Z0J7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf15Q9Z0J7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms