Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gipc1Q9Z0G0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gipc1Q9Z0G0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gipc1Q9Z0G0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gipc1Q9Z0G0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gipc1Q9Z0G0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gipc1Q9Z0G0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gipc1Q9Z0G0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gipc1Q9Z0G0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc1Q9Z0G0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc1Q9Z0G0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc1Q9Z0G0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gipc1Q9Z0G0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms