Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Katna1Q9WV86 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Katna1Q9WV86 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Katna1Q9WV86 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Katna1Q9WV86 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Katna1Q9WV86 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Katna1Q9WV86 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Katna1Q9WV86 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Katna1Q9WV86 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms