Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcd7Q9WTY1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcd7Q9WTY1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd7Q9WTY1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd7Q9WTY1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd7Q9WTY1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcd7Q9WTY1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdcd7Q9WTY1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdcd7Q9WTY1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdcd7Q9WTY1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdcd7Q9WTY1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd7Q9WTY1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdcd7Q9WTY1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd7Q9WTY1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdcd7Q9WTY1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcd7Q9WTY1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd7Q9WTY1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcd7Q9WTY1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd7Q9WTY1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd7Q9WTY1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcd7Q9WTY1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcd7Q9WTY1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcd7Q9WTY1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcd7Q9WTY1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd7Q9WTY1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd7Q9WTY1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd7Q9WTY1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd7Q9WTY1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd7Q9WTY1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd7Q9WTY1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd7Q9WTY1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd7Q9WTY1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd7Q9WTY1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd7Q9WTY1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd7Q9WTY1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd7Q9WTY1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms