Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cul1Q9WTX6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cul1Q9WTX6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cul1Q9WTX6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cul1Q9WTX6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cul1Q9WTX6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cul1Q9WTX6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cul1Q9WTX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cul1Q9WTX6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cul1Q9WTX6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cul1Q9WTX6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cul1Q9WTX6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cul1Q9WTX6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cul1Q9WTX6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cul1Q9WTX6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul1Q9WTX6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cul1Q9WTX6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cul1Q9WTX6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms