Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42.39■■■■■ 4.38
NrkQ9R0G8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NrkQ9R0G8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
NrkQ9R0G8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
NrkQ9R0G8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NrkQ9R0G8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NrkQ9R0G8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NrkQ9R0G8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NrkQ9R0G8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NrkQ9R0G8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
NrkQ9R0G8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NrkQ9R0G8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NrkQ9R0G8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NrkQ9R0G8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NrkQ9R0G8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NrkQ9R0G8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NrkQ9R0G8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NrkQ9R0G8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
NrkQ9R0G8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
NrkQ9R0G8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NrkQ9R0G8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
NrkQ9R0G8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
NrkQ9R0G8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
NrkQ9R0G8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
NrkQ9R0G8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NrkQ9R0G8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NrkQ9R0G8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
NrkQ9R0G8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NrkQ9R0G8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
NrkQ9R0G8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
NrkQ9R0G8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NrkQ9R0G8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NrkQ9R0G8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
NrkQ9R0G8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
NrkQ9R0G8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NrkQ9R0G8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NrkQ9R0G8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NrkQ9R0G8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NrkQ9R0G8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NrkQ9R0G8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
NrkQ9R0G8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NrkQ9R0G8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NrkQ9R0G8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
NrkQ9R0G8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
NrkQ9R0G8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
NrkQ9R0G8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NrkQ9R0G8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
NrkQ9R0G8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NrkQ9R0G8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
NrkQ9R0G8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NrkQ9R0G8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
NrkQ9R0G8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
NrkQ9R0G8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.28
NrkQ9R0G8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NrkQ9R0G8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
NrkQ9R0G8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
NrkQ9R0G8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
NrkQ9R0G8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NrkQ9R0G8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NrkQ9R0G8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
NrkQ9R0G8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NrkQ9R0G8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NrkQ9R0G8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
NrkQ9R0G8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NrkQ9R0G8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NrkQ9R0G8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
NrkQ9R0G8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NrkQ9R0G8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NrkQ9R0G8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NrkQ9R0G8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NrkQ9R0G8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
NrkQ9R0G8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
NrkQ9R0G8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
NrkQ9R0G8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NrkQ9R0G8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NrkQ9R0G8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NrkQ9R0G8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NrkQ9R0G8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NrkQ9R0G8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NrkQ9R0G8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
NrkQ9R0G8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NrkQ9R0G8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NrkQ9R0G8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NrkQ9R0G8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
NrkQ9R0G8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
NrkQ9R0G8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
NrkQ9R0G8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NrkQ9R0G8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NrkQ9R0G8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NrkQ9R0G8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NrkQ9R0G8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NrkQ9R0G8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms