Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp11cQ9QZW0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp11cQ9QZW0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp11cQ9QZW0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp11cQ9QZW0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp11cQ9QZW0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp11cQ9QZW0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp11cQ9QZW0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp11cQ9QZW0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp11cQ9QZW0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp11cQ9QZW0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp11cQ9QZW0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp11cQ9QZW0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp11cQ9QZW0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp11cQ9QZW0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp11cQ9QZW0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp11cQ9QZW0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp11cQ9QZW0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp11cQ9QZW0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp11cQ9QZW0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp11cQ9QZW0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp11cQ9QZW0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp11cQ9QZW0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms