Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tnnt3Q9QZ47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Tnnt3Q9QZ47 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Tnnt3Q9QZ47 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tnnt3Q9QZ47 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Tnnt3Q9QZ47 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Tnnt3Q9QZ47 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Tnnt3Q9QZ47 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tnnt3Q9QZ47 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Tnnt3Q9QZ47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Tnnt3Q9QZ47 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Tnnt3Q9QZ47 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tnnt3Q9QZ47 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tnnt3Q9QZ47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Tnnt3Q9QZ47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tnnt3Q9QZ47 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tnnt3Q9QZ47 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tnnt3Q9QZ47 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tnnt3Q9QZ47 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tnnt3Q9QZ47 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tnnt3Q9QZ47 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tnnt3Q9QZ47 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tnnt3Q9QZ47 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tnnt3Q9QZ47 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tnnt3Q9QZ47 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tnnt3Q9QZ47 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Tnnt3Q9QZ47 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Tnnt3Q9QZ47 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tnnt3Q9QZ47 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tnnt3Q9QZ47 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tnnt3Q9QZ47 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tnnt3Q9QZ47 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tnnt3Q9QZ47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tnnt3Q9QZ47 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tnnt3Q9QZ47 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tnnt3Q9QZ47 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tnnt3Q9QZ47 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tnnt3Q9QZ47 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Tnnt3Q9QZ47 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tnnt3Q9QZ47 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tnnt3Q9QZ47 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tnnt3Q9QZ47 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms