Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tnnt3Q9QZ47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tnnt3Q9QZ47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tnnt3Q9QZ47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tnnt3Q9QZ47 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Tnnt3Q9QZ47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tnnt3Q9QZ47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tnnt3Q9QZ47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tnnt3Q9QZ47 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Tnnt3Q9QZ47 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tnnt3Q9QZ47 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tnnt3Q9QZ47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tnnt3Q9QZ47 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tnnt3Q9QZ47 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tnnt3Q9QZ47 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tnnt3Q9QZ47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tnnt3Q9QZ47 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tnnt3Q9QZ47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tnnt3Q9QZ47 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tnnt3Q9QZ47 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tnnt3Q9QZ47 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tnnt3Q9QZ47 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tnnt3Q9QZ47 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tnnt3Q9QZ47 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tnnt3Q9QZ47 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tnnt3Q9QZ47 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tnnt3Q9QZ47 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tnnt3Q9QZ47 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tnnt3Q9QZ47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tnnt3Q9QZ47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tnnt3Q9QZ47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tnnt3Q9QZ47 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Tnnt3Q9QZ47 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Tnnt3Q9QZ47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tnnt3Q9QZ47 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tnnt3Q9QZ47 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tnnt3Q9QZ47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tnnt3Q9QZ47 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tnnt3Q9QZ47 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tnnt3Q9QZ47 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tnnt3Q9QZ47 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tnnt3Q9QZ47 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tnnt3Q9QZ47 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Tnnt3Q9QZ47 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tnnt3Q9QZ47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tnnt3Q9QZ47 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Tnnt3Q9QZ47 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tnnt3Q9QZ47 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tnnt3Q9QZ47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tnnt3Q9QZ47 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tnnt3Q9QZ47 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Tnnt3Q9QZ47 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tnnt3Q9QZ47 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tnnt3Q9QZ47 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Tnnt3Q9QZ47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Tnnt3Q9QZ47 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tnnt3Q9QZ47 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tnnt3Q9QZ47 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tnnt3Q9QZ47 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Tnnt3Q9QZ47 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tnnt3Q9QZ47 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tnnt3Q9QZ47 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tnnt3Q9QZ47 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Tnnt3Q9QZ47 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Tnnt3Q9QZ47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Tnnt3Q9QZ47 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Tnnt3Q9QZ47 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tnnt3Q9QZ47 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tnnt3Q9QZ47 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms