Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Irx4Q9QY61 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Irx4Q9QY61 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Irx4Q9QY61 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irx4Q9QY61 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx4Q9QY61 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx4Q9QY61 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx4Q9QY61 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx4Q9QY61 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx4Q9QY61 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx4Q9QY61 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irx4Q9QY61 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx4Q9QY61 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Irx4Q9QY61 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx4Q9QY61 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx4Q9QY61 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx4Q9QY61 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx4Q9QY61 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx4Q9QY61 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx4Q9QY61 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx4Q9QY61 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx4Q9QY61 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx4Q9QY61 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx4Q9QY61 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx4Q9QY61 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms