Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tspan3Q9QY33 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tspan3Q9QY33 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tspan3Q9QY33 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tspan3Q9QY33 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tspan3Q9QY33 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tspan3Q9QY33 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tspan3Q9QY33 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tspan3Q9QY33 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tspan3Q9QY33 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tspan3Q9QY33 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tspan3Q9QY33 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tspan3Q9QY33 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tspan3Q9QY33 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tspan3Q9QY33 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tspan3Q9QY33 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tspan3Q9QY33 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tspan3Q9QY33 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tspan3Q9QY33 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tspan3Q9QY33 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tspan3Q9QY33 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tspan3Q9QY33 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tspan3Q9QY33 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tspan3Q9QY33 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tspan3Q9QY33 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tspan3Q9QY33 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tspan3Q9QY33 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tspan3Q9QY33 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms