Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cbx8Q9QXV1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cbx8Q9QXV1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cbx8Q9QXV1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cbx8Q9QXV1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cbx8Q9QXV1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cbx8Q9QXV1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cbx8Q9QXV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cbx8Q9QXV1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cbx8Q9QXV1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cbx8Q9QXV1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cbx8Q9QXV1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cbx8Q9QXV1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cbx8Q9QXV1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cbx8Q9QXV1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cbx8Q9QXV1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cbx8Q9QXV1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cbx8Q9QXV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cbx8Q9QXV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cbx8Q9QXV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cbx8Q9QXV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cbx8Q9QXV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cbx8Q9QXV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cbx8Q9QXV1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cbx8Q9QXV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx8Q9QXV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx8Q9QXV1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx8Q9QXV1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbx8Q9QXV1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cbx8Q9QXV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cbx8Q9QXV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cbx8Q9QXV1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cbx8Q9QXV1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cbx8Q9QXV1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cbx8Q9QXV1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cbx8Q9QXV1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cbx8Q9QXV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cbx8Q9QXV1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cbx8Q9QXV1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx8Q9QXV1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cbx8Q9QXV1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx8Q9QXV1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cbx8Q9QXV1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cbx8Q9QXV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cbx8Q9QXV1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms