Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cml5Q9QXS8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cml5Q9QXS8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cml5Q9QXS8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cml5Q9QXS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cml5Q9QXS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cml5Q9QXS8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cml5Q9QXS8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cml5Q9QXS8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cml5Q9QXS8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cml5Q9QXS8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cml5Q9QXS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cml5Q9QXS8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cml5Q9QXS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cml5Q9QXS8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cml5Q9QXS8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms