Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV9

Ccnt1, Cyclin-T1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnt1Q9QWV9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccnt1Q9QWV9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccnt1Q9QWV9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccnt1Q9QWV9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccnt1Q9QWV9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccnt1Q9QWV9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccnt1Q9QWV9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccnt1Q9QWV9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccnt1Q9QWV9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccnt1Q9QWV9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccnt1Q9QWV9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccnt1Q9QWV9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccnt1Q9QWV9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccnt1Q9QWV9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccnt1Q9QWV9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccnt1Q9QWV9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccnt1Q9QWV9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccnt1Q9QWV9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccnt1Q9QWV9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccnt1Q9QWV9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccnt1Q9QWV9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccnt1Q9QWV9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccnt1Q9QWV9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccnt1Q9QWV9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccnt1Q9QWV9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccnt1Q9QWV9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccnt1Q9QWV9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccnt1Q9QWV9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms