Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcea2Q9QVN7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcea2Q9QVN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcea2Q9QVN7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcea2Q9QVN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcea2Q9QVN7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcea2Q9QVN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcea2Q9QVN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcea2Q9QVN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcea2Q9QVN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcea2Q9QVN7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcea2Q9QVN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcea2Q9QVN7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcea2Q9QVN7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcea2Q9QVN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcea2Q9QVN7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcea2Q9QVN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcea2Q9QVN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcea2Q9QVN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms