Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calm4Q9JM83 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Calm4Q9JM83 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calm4Q9JM83 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calm4Q9JM83 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Calm4Q9JM83 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Calm4Q9JM83 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Calm4Q9JM83 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Calm4Q9JM83 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Calm4Q9JM83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms