Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PnkpQ9JLV6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PnkpQ9JLV6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PnkpQ9JLV6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PnkpQ9JLV6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PnkpQ9JLV6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PnkpQ9JLV6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PnkpQ9JLV6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PnkpQ9JLV6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PnkpQ9JLV6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PnkpQ9JLV6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PnkpQ9JLV6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PnkpQ9JLV6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PnkpQ9JLV6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PnkpQ9JLV6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PnkpQ9JLV6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PnkpQ9JLV6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PnkpQ9JLV6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms