Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp39a1Q9JKJ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cyp39a1Q9JKJ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp39a1Q9JKJ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cyp39a1Q9JKJ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp39a1Q9JKJ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp39a1Q9JKJ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cyp39a1Q9JKJ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp39a1Q9JKJ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms