Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alyref2Q9JJW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alyref2Q9JJW6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alyref2Q9JJW6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alyref2Q9JJW6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alyref2Q9JJW6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alyref2Q9JJW6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alyref2Q9JJW6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alyref2Q9JJW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alyref2Q9JJW6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alyref2Q9JJW6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alyref2Q9JJW6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alyref2Q9JJW6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Alyref2Q9JJW6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Alyref2Q9JJW6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms