Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr12Q9JJA4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr12Q9JJA4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr12Q9JJA4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr12Q9JJA4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr12Q9JJA4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr12Q9JJA4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr12Q9JJA4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdr12Q9JJA4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr12Q9JJA4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr12Q9JJA4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Wdr12Q9JJA4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr12Q9JJA4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr12Q9JJA4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr12Q9JJA4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr12Q9JJA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr12Q9JJA4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr12Q9JJA4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr12Q9JJA4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr12Q9JJA4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr12Q9JJA4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr12Q9JJA4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr12Q9JJA4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr12Q9JJA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr12Q9JJA4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr12Q9JJA4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms