Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHX2

Sp5, Transcription factor Sp5, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp5Q9JHX2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp5Q9JHX2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp5Q9JHX2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sp5Q9JHX2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sp5Q9JHX2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp5Q9JHX2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp5Q9JHX2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sp5Q9JHX2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sp5Q9JHX2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp5Q9JHX2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp5Q9JHX2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp5Q9JHX2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp5Q9JHX2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp5Q9JHX2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp5Q9JHX2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp5Q9JHX2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp5Q9JHX2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp5Q9JHX2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp5Q9JHX2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp5Q9JHX2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp5Q9JHX2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp5Q9JHX2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sp5Q9JHX2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp5Q9JHX2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp5Q9JHX2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp5Q9JHX2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sp5Q9JHX2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp5Q9JHX2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp5Q9JHX2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp5Q9JHX2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp5Q9JHX2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp5Q9JHX2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp5Q9JHX2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp5Q9JHX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp5Q9JHX2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp5Q9JHX2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp5Q9JHX2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms