Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrip2Q9JHR9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrip2Q9JHR9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrip2Q9JHR9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrip2Q9JHR9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip2Q9JHR9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip2Q9JHR9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrip2Q9JHR9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrip2Q9JHR9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrip2Q9JHR9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrip2Q9JHR9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrip2Q9JHR9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nrip2Q9JHR9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrip2Q9JHR9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrip2Q9JHR9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrip2Q9JHR9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrip2Q9JHR9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrip2Q9JHR9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrip2Q9JHR9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrip2Q9JHR9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrip2Q9JHR9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrip2Q9JHR9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrip2Q9JHR9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nrip2Q9JHR9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrip2Q9JHR9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrip2Q9JHR9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrip2Q9JHR9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrip2Q9JHR9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms