Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tssc4Q9JHE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tssc4Q9JHE7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tssc4Q9JHE7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tssc4Q9JHE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tssc4Q9JHE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tssc4Q9JHE7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tssc4Q9JHE7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tssc4Q9JHE7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tssc4Q9JHE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tssc4Q9JHE7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tssc4Q9JHE7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tssc4Q9JHE7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tssc4Q9JHE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tssc4Q9JHE7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tssc4Q9JHE7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tssc4Q9JHE7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tssc4Q9JHE7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms