Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms