Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufa13Q9ERS2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufa13Q9ERS2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufa13Q9ERS2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufa13Q9ERS2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufa13Q9ERS2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufa13Q9ERS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufa13Q9ERS2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufa13Q9ERS2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufa13Q9ERS2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufa13Q9ERS2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufa13Q9ERS2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufa13Q9ERS2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufa13Q9ERS2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufa13Q9ERS2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufa13Q9ERS2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufa13Q9ERS2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufa13Q9ERS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufa13Q9ERS2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufa13Q9ERS2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufa13Q9ERS2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufa13Q9ERS2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufa13Q9ERS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufa13Q9ERS2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndufa13Q9ERS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndufa13Q9ERS2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufa13Q9ERS2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufa13Q9ERS2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndufa13Q9ERS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa13Q9ERS2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms