Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcr6Q9EQ16 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcr6Q9EQ16 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcr6Q9EQ16 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cxcr6Q9EQ16 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cxcr6Q9EQ16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cxcr6Q9EQ16 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cxcr6Q9EQ16 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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