Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rpgrip1Q9EPQ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rpgrip1Q9EPQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rpgrip1Q9EPQ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rpgrip1Q9EPQ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms