Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv4Q9EPK8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv4Q9EPK8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv4Q9EPK8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpv4Q9EPK8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpv4Q9EPK8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv4Q9EPK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv4Q9EPK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpv4Q9EPK8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpv4Q9EPK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpv4Q9EPK8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpv4Q9EPK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpv4Q9EPK8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv4Q9EPK8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpv4Q9EPK8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpv4Q9EPK8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpv4Q9EPK8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpv4Q9EPK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv4Q9EPK8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv4Q9EPK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpv4Q9EPK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpv4Q9EPK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpv4Q9EPK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv4Q9EPK8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv4Q9EPK8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv4Q9EPK8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv4Q9EPK8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv4Q9EPK8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv4Q9EPK8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms