Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP96

Slco1a4, Solute carrier organic anion transporter family member 1A4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a4Q9EP96 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slco1a4Q9EP96 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slco1a4Q9EP96 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slco1a4Q9EP96 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slco1a4Q9EP96 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slco1a4Q9EP96 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1a4Q9EP96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slco1a4Q9EP96 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slco1a4Q9EP96 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slco1a4Q9EP96 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1a4Q9EP96 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slco1a4Q9EP96 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1a4Q9EP96 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco1a4Q9EP96 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco1a4Q9EP96 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slco1a4Q9EP96 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1a4Q9EP96 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco1a4Q9EP96 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms